燃える雑記置き場
随分とブログから遠ざかっておりまして、閉鎖も念頭に入れてはいますが…いくつかのメモは残しておきたいところなので、もうしばらくお目見汚しを。
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Structure (Get the software) ver. 2.1

Jonathan K. Pritchard, Matthew Stephens and Peter Donnelly. 2000. Inference of Population Structure Using Multilocus Genotype Data. Genetics 155: 945–959.

Daniel Falush, Matthew Stephens and Jonathan K. Pritchard. 2003. Inference of Population Structure Using Multilocus Genotype Data:
Linked Loci and Correlated Allele Frequencies. Genetics 164: 1567–1587.

モデルをベースにしたクラスタリングによって、MultilocusのGenotype dataから集団の構造を推測。
対立遺伝子頻度より、各個体を仮定したK個の集団に割り振る。



プログラムも難なく動くのだが…

確かに、理解はしがたい。でもね…
どのKを選択すべきかくらいは理解して欲しいのだが…

てか、自分のデータには全く不必要な解析なんですが…

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